故事的舞台是互联网系统发达(dá )的都市「DEN CITY」。在那里有经由巨型企业「SOL技术社」通过高度的网络技术构筑而成的被称为「LINK VRAINS」的VR空间。人们都在那个VR空间中为体验到全新的决斗而狂热。可是在「LINK VRAINS」中却出(chū )现了利用决斗来(lái )进行黑客行为的谜之黑客集团「海诺因骑士团」。而他们的目标是将存在于互联网的(de )某处的“AI们的世(shì )界=电子界”毁灭。然而在世界受到(dào )这样(yàng )的威胁时，有一名决斗者站了出来。而他的名字正是「Playmaker」。在那场传(chuán )奇的战斗中，「Playmaker」使用压(yā )倒性的决(jué )斗将「海诺因骑士团」打倒，成功捕获了「SOL技术社」和「海诺因骑士团」都想要得手的迷之AI程序。一度拯救了(le )世界，然后却突然消声匿迹了，而他的名字就在(zài )互联网的世界中一瞬间变得(dé )声名远播，成为了传说。而现在，作为「Playmaker」的正体的某位高中生藤木游作，为了寻找过去发生(shēng )的某(mǒu )件事件(jiàn )的真相，对再次在「VRAINS」出现的「海诺因骑士团」展开了追击......  以此为契机(jī )，命运的齿轮就此转动……迷之AI的真身(shēn )，「海诺因骑士团」盯上「Link Vrains」的目的，以及隐藏在游作过去的真相到底是———所有的(de )答案，都在「Link Vrains」中