故事的舞台是互联网系统发达的都市「DEN CITY」。在那里有经由巨型企业「SOL技术社」通过高度的网络技术(shù )构筑而成的被称为「LINK VRAINS」的VR空间。人们都在那个VR空间中为体验到全新的决(jué )斗而狂热(rè )。可是在「LINK VRAINS」中却出现了利用决斗来进行黑客行为的(de )谜之黑客集团「海诺因骑士团(tuán )」。而他们(men )的目标是将存在于互联网的某处的(de )“AI们的世(shì )界=电子界”毁灭。然而在世界受(shòu )到这样的威胁时，有一名决斗者站了(le )出来。而他的名字正是「Playmaker」。在那场传奇的战斗中，「Playmaker」使用压倒性的决斗将「海诺因骑士团」打倒，成功捕获了「SOL技术社」和「海诺因骑士(shì )团」都想要得手的迷之AI程序。一度拯救了世界，然后却(què )突然消声匿迹(jì )了，而他的名字就在互联网的世界中一瞬间变得声名远播，成为了传说。而现在，作为「Playmaker」的正体的某位高中生藤木游作，为了寻找过去发(fā )生的某件事件的真相，对(duì )再次在「VRAINS」出现的「海诺因骑士团」展开了(le )追击......  以此为契机，命运的齿轮就此转动……迷之AI的真身，「海诺因骑士团」盯上「Link Vrains」的目的，以及(jí )隐藏在游作过去的真相到底是———所有的答案(àn )，都在(zài )「Link Vrains」中